La colección de impresos del S.XVI está compuesta por  aproximadamente ochocientos volúmenes de las más variadas materias, aunque predominan la religión, la filosofía y el derecho, también están representadas la medicina, la geografía, las matemáticas, la historia natural o la farmacopea.

Entre las obras religiosas se conservan ocho Biblias: un ejemplar impreso en Lyon en  1599  bajo los auspicios de Benito Arias Montano ; tres hebreas impresas en Basilea, París y Roma en 1545, 1546 y 1587 respectivamente, y las cuatro restantes latinas impresas en Francfurt, Amberes, Lyon, Roma y Colonia entre 1566 y 1592.

Cabe destacar entre los textos científicos el notable ejemplar  Egidius de urinis [et] pulsibus. Petrus Leo de urinis, impreso en Venecia en 1514; el Theatrum Orbis de Abraham Ortelio impreso en Amberes en 1595; o la  traducción de la obra  de Dioscórides  Acerca de la materia medicinal, por Andrés de Laguna, impresa en Salamanca en 1586.

La colección se puede consultar en el catálogo en línea y está en proceso de digitalización.